Roche LightCycler® 480 RT PCR仪通过荧光染料在线、实时监测循环扩增阶段PCR产物的产生以及利用荧光染料在PCR后熔解曲线分析中分析PCR产物熔解。循环扩增阶段测量的荧光信号与PCR产物量相关，从而可以计算靶核酸的复制数量。PCR后熔解曲线分析阶段，荧光测量可用于PCR产物鉴定和基因分型。